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La MRCT est une structure interdisciplinaire originale ayant un rôle directement opérationnel et qui initie des actions transversales fondées sur les technologies. Ces actions bénéficient à l’ensemble des disciplines scientifiques et permettent ainsi de fédérer en profondeur des communautés d’origines diverses. Elles prennent également en compte la composante humaine (évolution des compétences et des savoir-faire en particulier face aux échéances de nombreux départs d’agents). La fonction de pilotage de la MRCT est assurée par le Comité des Ressources et Compétences Technologiques (CORTECH). Il est composé de personnalités ayant des rôles décisionnels, scientifiques ou administratifs ; elles représentent les différentes sensibilités de l’établissement. Le rôle opérationnel quotidien de mise en œuvre des décisions et de suivi des actions est confié à une unité de service (l’UPS 2274) qui opère essentiellement suivant un mode de gestion par projets. La structure centrale légère de pilotage bénéficie de la collaboration de plus de 400 agents dans les laboratoires, les comités de pilotage des réseaux et les délégations régionales.